路由器自组网和上层网关组网的主要区别体现在网络结构、功能、稳定性和适用范围等方面。

网络结构：路由器自组网通常指的是通过多个路由器相互连接，形成一个局域网或广域网。在这种组网方式下，每个路由器都充当着网络节点，负责转发数据包，实现不同网络之间的通信。而上层网关组网则是指通过网络中的上层设备（如网关、交换机等）将不同的网络连接起来。在这种组网方式下，上层设备扮演着更加重要的角色，负责管理和控制网络的通信。

功能：路由器自组网主要侧重于实现网络的连通性和数据的转发，通过配置路由协议和策略，实现不同网络之间的通信。而上层网关组网则具有更多的功能，如网络管理、安全控制、流量控制等，可以实现对整个网络的全面管理和控制。

稳定性：路由器自组网的稳定性相对较低，因为每个路由器都可能成为网络的瓶颈或故障点。一旦某个路由器出现故障或配置错误，可能会导致整个网络的通信中断。而上层网关组网的稳定性相对较高，因为上层设备通常具有更高的性能和更可靠的设计，可以更好地保证网络的稳定性和可靠性。

适用范围：路由器自组网适用于小型网络或特定场景下的网络连接，如家庭网络、企业局域网等。而上层网关组网则适用于大型网络或复杂的网络环境，如运营商网络、数据中心等。在这些场景下，需要更加全面的网络管理和控制功能来保证网络的正常运行。

综上所述，路由器自组网和上层网关组网的主要区别在于网络结构、功能、稳定性和适用范围等方面。在实际应用中，需要根据具体的需求和场景选择合适的组网方式。