在于其使用的平台不同。
橱窗保证金是指在阿里巴巴的1688平台上，商家为了在自己的店铺页面上展示商品而需要交纳的费用，保证该店铺中所有橱窗展示商品的付款率和成交率。
而小店保证金指的是在淘宝平台上开设店铺所需缴纳的保证金，以保证店铺能够正常经营和遵守平台规则，同时保证消费者的权益和利益不受损失。
因此，橱窗保证金和小店保证金的主要区别在于其使用的平台和缴纳的目的。
橱窗保证金补缴到3000是因为店铺铺货品数量达到或超过了橱窗格数的要求。
在电商平台上，商家可以通过购买橱窗位来提高商品的曝光率和点击率。
为了保证橱窗展示的商品质量和店铺的活跃度，平台要求商家在铺满橱窗位后，需要支付一定数额的保证金，以防止商家恶意占领橱窗位而不出售商品。
当店铺的货品数量不足以铺满橱窗位时，不需要补缴保证金。
但如果商家增加了货品数量，使其能够铺满橱窗位，则需要补缴保证金，常见的补缴金额为3000元。
总之，保证金补缴到3000是为了保证橱窗展示商品的质量和店铺的活跃度，是电商平台的一种规定。