噻菌铜可以和大多数的农药混用，可和杀菌剂，杀虫剂，生长调节剂，叶面肥，微肥，液体肥混用，都有增效的作用。
它的主要优势是防治细菌类的病害，若是和杀菌剂混用，不仅可防治病害，还可提高药效，节省成本。若是和调节剂混合，不仅可控病，还可促进生长，一举多得。
可以混用，但需要注意一些问题。
因为噻虫胺是一种杀虫剂，对微生物菌肥有一定的影响，可能会对土壤中的生态环境造成一定的影响，而且可能会影响微生物菌肥的生长和活性。
但是，如果按照正确的方法和比例混合使用，可以避免这些问题的发生。
需要注意的是，在使用过程中要避免噻虫胺与微生物菌肥直接接触或混合使用。
同时，应按照噻虫胺使用说明书上的建议进行混合使用，同时注意控制使用的剂量和时间，避免对土壤环境和微生物菌肥造成不必要的损害。