施工单位是可以选择分包单位的。
施工单位在承建工程时，如果遇到比较特殊或专业性较强的设备工程时，是可以把该部分工程分包给专业的设备商去处理的，例如：防火门、防火窗等都是必须由经国家消防部门审核认定的合资格厂家来生产的，普通施工单位是无法制作该类门窗的，这时候就必须把该类门窗的制作分包给门窗生产商。
关于施工单位给甲方开票的流程如下：
1. 确定开票信息：施工单位需要确定甲方的开票信息，包括单位名称、纳税人识别号、地址、电话、开户行及账号等。确保开票信息准确无误。
2. 签订合同：施工单位需要与甲方签订合同，明确工程内容、工程金额、开票时间、开票类型等事项。
3. 开具发票：施工单位根据合同约定，开具相应的发票。发票内容应与合同约定一致。
4. 递交发票：施工单位将开具的发票递交给甲方，并保留发票的复印件或扫描件以备查验。
5. 确认发票：甲方收到发票后，应及时核对发票内容是否正确，是否符合要求。如有问题，应及时与施工单位联系解决。
6. 付款：甲方在确认发票无误后，应按照合同约定的付款方式进行付款。
需要注意的是，发票是重要的会计凭证，施工单位和甲方都应妥善保管，以备查验。同时，施工单位应按照国家有关规定，及时、足额地缴纳税款。