南京银行存款超50万元不安全。凡是个人银行存款50万元，假如银行倒闭破产，50万元有保险公司赔付，超过50万元不赔付，南京银行存款不要超50万元，分散其他行存。
一般来说，在南京银行存80万是安全的，但是建议在同一家银行的存款最好不要超过50万。这是因为我们国家的存款保险最多保50万人民币。建议在南京银行存50万，剩下的30万换另一家银行存入。
现在大多数银行的存款开出来的存单一般都是电子存单。不和以前一样的存单。因为电子存单存在电脑上随时可以查到。方便今后有什么可以去电脑查询。