单病种报销是指保险公司只承担患有某一特定疾病的医疗费用，而对于其他疾病的医疗费用不予承担。多病种报销则是指保险公司承担患有多种疾病的医疗费用。
在单病种报销中，患有其他疾病的医疗费用需要患者自行承担，这就对患有多种疾病的患者来说可能会造成经济负担。
而在多病种报销中，保险公司承担患者同时患有的多种疾病的医疗费用，减轻了患者的经济负担。
因此，对于患有多种疾病的患者来说，多病种报销更加有利，能够减轻患者的经济压力。
1、单病种报销一般是限额报销，即社保机构认定该病种的治疗费用为某一个固定金额，不涉及到其中费用核算等。简而言之就是明确规定某一种疾病该花多少钱，从而既避免了医疗单位滥用医疗服务项目、重复项目和分解项目，防止医院小病大治，又保证了医疗服务质量。
2、非单病种的话就要依据当事人的起付线、具体花费金额等进行核算，以核算结果为准进行报销。